O Panamá é o único excluído dessa lista. Para passageiros com stopover no Panamá, toda a franquia deve ser aplicada a partir do trecho inicial da viagem — ou seja, a validando a estação final do destino.
A cobrança da segunda mala não é realizada para passagens aereas compradas na categoria Econômica Flex. Para os passageiros dessa categoria, é permitido transportar duas malas de 23 quilos cada uma. Segundo a companhia, será permitido registrar peças adicionais com a aplicação do valor correspondente.
No Brasil, a Copa Airlines opera voos em Salvador, Fortaleza, Recife, Manaus, Brasília, Belo Horizonte, Porto Alegre, Rio de Janeiro e São Paulo, com voos diretos para o Aeroporto Internacional Tocumen, hub da companhia aérea que possibilita conexões para outros 79 destinos em 32 países diferentes da América do Norte, Central, Caribe e América do Sul.